Após a Festa do Ano do Dragão, o Mundo dos Dragões comemora a entrega dos Dragonflies aos novos dragões do mundo. Dragonfly é uma criatura que dá energia aos dragões, como Sparx.

        Mas, três convidados indesejáveis surgiram na festa: Ripto, Gulp e Crush. Os súditos de Ripto roubaram os 90 Dragonflies e espalharam todos pelo Mundo dos Dragões. A partir desse fato, Spyro, Sparx, Hunter e Bianca vão à procura dos Dragonflies. É essa a missão deles, mas não será fácil.

        Durante a aventura, Spyro conquista novos tipos de baforada: bolha (usado para capturar os dragonflies), eletricidade e gelo. Além disso, ele aprende a usar outros tipos de equipamentos e transportes, como avião e tanque de guerra.

        É missão de nossos amigos recuperar os 90 Dragonflies e as 7.000 jóias espalhadas pelos riptocs nos 9 mundos do Reino dos Dragões.