Em Crash Twinsanity 3D você terá a jogabilidade tradicional da série onde poderá correr em qualquer direção, pular, dar pulo duplo, girar e cair de barriga. Assim como nas fases da versão para consoles, aqui você irá usar Cortex em alguns momentos. O jogo tem um modo Time Trial que é ativado ao encostar no relógio.